上海清算所债券集中清算业务包含银行间债券市场债券交易净额清算业务（以下简称债券净额清算业务）、银行间债券市场通用回购交易清算业务（以下简称通用回购业务）、银行间市场中央债券借贷业务（以下简称中央债券借贷业务）。

　　债券净额清算业务是指市场参与者将其达成的现券交易、质押式回购交易、买断式回购交易，提交上海清算所进行集中清算，由上海清算所作为中央对手方，在承继交易双方成交合同的权利和义务后，按多边净额方式轧差计算各债券净额清算会员在相同结算日的应收或应付资金、应收或应付债券、应质押或应释放债券，并建立相应风险控制机制，以保证资金结算和债券结算顺利完成的过程。

　　通用回购业务是指采用集中清算的三方回购交易业务。银行间债券市场业务参与者将符合上海清算所要求的债券提交担保券库，上海清算所对担保券库的债券按照折扣率进行计算，业务参与者在额度范围内通过同业拆借中心开展回购交易。开展通用回购交易时，业务参与者需自行确定回购金额、利率和期限等要素，对应的担保券由上海清算所自动选取、结算并进行存续期管理，包括估值盯市和担保券替换等。

　　中央债券借贷业务是指采取中央对手方机制的集中债券借贷业务，是为满足业务参与者的债券结算需要，以提升债券结算成功率为目的建立的风险防范配套机制。上海清算所根据借出方指定的可借债券建立可借债券池，当借入方结算日应付债券不足时，通过同业拆借中心发起借贷指令，由上海清算所自动完成标的债券的匹配和借入、担保债券的管理以及到期结算交收。